FastQCFastQC Report
Fri 16 Jan 2026
M2D150_R2.fastq

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameM2D150_R2.fastq
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences9375
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length247-251
%GC55

[FAIL]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[WARN]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
CCTGTTCGATCCCCGCACTTTCGTGCCTCAGCGTCAGTAGGGCGCCGGAA129213.781333333333334No Hit
CCTGTTCGATACCCACACTTTCGTGCATGAGCGTCAGTTGAGCGCCGGTA108611.584No Hit
CCTGTTTGATCCCCGCACTTTCGTGCCTCAGCGTCAGTAGGGCGCCGGTA8228.767999999999999No Hit
CCTGTTCGATACCCACGCTTTCGTGCATGAGCGTCAGTTGCGCGCCGGTA7197.669333333333333No Hit
CCTGTTCGATACCCACGCTTTCGTGCCTCAGCGTCAGTAGGGCGCCGGTA5636.005333333333334No Hit
CCTGTTTGATCCCCGCACTTTCGTGCCTCAGCGTCAGTCGGGCGCCGGTA3994.256No Hit
CCTGTTTGATACCCACACTTTCGAGCATCAGTGTCAGTTGCAGTCCAGTG3774.021333333333333No Hit
CCTGTTCGATACCCACGCTTTCGTGCATGAGCGTCAGTTGGGCGCCGGTA3403.626666666666667No Hit
CCTGTTCGATACCCACGCTTTCGTGCTTCAGCGTCAGTTGGGCGCCGGTA2953.1466666666666665No Hit
CCTGTTCGATACCCACGCTTTCGTGCCTCAGCGTCAGTCGGGCGCCGGTA2893.0826666666666664No Hit
CCTGTTCGATCCCCACGCTTTCGTGCTTCAGCGTCAGTAGGAAGCCGGCA2592.7626666666666666No Hit
CCTGTTCGATACCCACGCTTTCGTGCTTCAGCGTCAGTAGGGCGCCGGTA2112.2506666666666666No Hit
CCTGTTCGCTACCCATGCTTTCGAGCCTCAGCGTCAGTTGCAGACCAGAG1942.0693333333333332No Hit
CCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGAGCCTCAACGTCAGTTACTGTCCAGCA1541.6426666666666665No Hit
CCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGAGCCTCAACGTCAGTTACAGTCCAGTA1051.1199999999999999No Hit
CCTGTTCGATACCCACGCTTTCGTGCATGAGCGTCAGTCGGGCGCCGGTA1011.0773333333333333No Hit
CCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGAGCCTCAACGTCAGTTACTGTCCAGTA900.96No Hit
CCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGTGCCTCAACGTCAGTCGTAGTTTGGTA830.8853333333333333No Hit
CCCTTTCGCTCCCCTGGCCTTCGTGCCTCAGCGTCAGTTAATGTCCAGGA790.8426666666666668No Hit
CCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCGCCTCAGTGTCAGTTGCAGACCAGGA780.832No Hit
CCTGTTCGATACCCACGCTTTCGTGCCTCAGCGTCAGATAGGAGCCGGTA680.7253333333333333No Hit
CCTGTTCGATACCCACGCTTTCGTGCCTCAGCGTCAGACAGGAGCCGGTA620.6613333333333333No Hit
CCTGTTCGCTCCCCACGCTTTCGGGCCTCAACGTCAGTTGCCGTCCAGTA580.6186666666666667No Hit
CCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGAGCCTCAACGTCAGTCATCGTCCAGCA500.5333333333333333No Hit
CCTGTTCGATCCCCACGCTTTCGTGCCTCAGCGTCAGTCTGGCGCCGGTA470.5013333333333333No Hit
CCTGTTTGCTCCCCACGCCTTCGAGCCTCAACGTCAGTTGCAGTCCAGCA420.44799999999999995No Hit
CCTGTTTGCTACCCACGCTTTCGAACCTCAGCGTCAGTTACAGACCAGAG370.39466666666666667No Hit
CCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGAGCCTCAACGTCAGTTACCGTCCAGTA360.384No Hit
CCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGAGCCTCAACGTCAGTTTCTGTCCAGCA340.36266666666666664No Hit
CCTGTTCGCTCCCCACGCTTTCGCTCCTCAGCGTCAGTAACGGCCCAGAG330.35200000000000004No Hit
CCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGAGCCTCAACGTCAGTTACAGTCCAGCA330.35200000000000004No Hit
CCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCGCCTCACCGTCAGTTGTCGTCCAGCA290.30933333333333335No Hit
CCTGTTTGATCCCCGCACTTTCGTGCCTCAGCGTCAGTAGGGCGCCGGAA220.23466666666666666No Hit
CCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCGCCTCACCGTCAGTTGCCGTCCAGTC200.21333333333333335No Hit
CCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGAGCCTCAGTGTCAGTTACAGTCCAGTA190.20266666666666666No Hit
CCTATTCGCTCCCCACGCTTTCGTCCCTGACCGTCAGTGATGGCCCAGCA190.20266666666666666No Hit
CCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGAGCCTCAGCGTCAGTTATCGTCCAGTA170.18133333333333332No Hit
CCTGTTTGCTACCCACGCTTTCGTGCTTCAGCGTCAGTTAAAGCCCAGCA170.18133333333333332No Hit
CCTGTTCGATCCCCGCACTTTCGTGCCTCAGCGTCAGTAGGGCGCCGGTA160.17066666666666666No Hit
CCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCGCCTCAGCGTCAGTTAATGTCCAGCA160.17066666666666666No Hit
CCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCGCCTCAGCGTCAGTCTTGGCCCAGAG150.16No Hit
CCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGAGCCTCAACGTCAGTTACGGTCCAGTA120.128No Hit
CCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGAGCCTCAACGTCAGTTACAGTCCAGTG120.128No Hit
CCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGAGCCTCAGCGTCAGTTGCCGTCCAGCA120.128No Hit
CCTGTTTGCTCCCCACACTTTCGAGCCTCAGCGTCAGTTAAAGCCCAGTT110.11733333333333333No Hit
CCTGTTTGCTCCCCACGCTCTCGAGCCTCAACGTCAGTCACGGTCCAGCA110.11733333333333333No Hit
CCTGTTCGATACCCACACTTTCGTGCATGAGCGTCAGTTGCGCGCCGGTA100.10666666666666667No Hit
CCTGTTCGATACCCACACTTTCGTGCCTGAGCGTCAGTTGAGCGCCGGTA100.10666666666666667No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)